中医健康管理师证发证机构是指负责颁发中医健康管理师资格证书的政府部门或事业单位，根据中国国家卫生健康委员会的规定，中医健康管理师证发证机构主要有以下几个部门：

1、国家卫生健康委员会(National Health Commission of the People's Republic of China,简称NHC)

国家卫生健康委员会是中华人民共和国国务院组成部门，主要负责制定和实施卫生健康政策、法规和标准，以及对全国卫生健康工作进行监督管理，NHC下设多个直属机构，如中医药管理局、卫生发展研究中心等，这些直属机构负责中医健康管理师证书的发放和管理。

2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会(Health Commission of Provinces, Autonomous Regions and Municipalities)

各省、自治区、直辖市卫生健康委员会是在国家卫生健康委员会的指导下，负责本行政区域内的卫生健康工作的政府机构，各级卫生健康委员会下设中医药管理部门，负责中医健康管理师证书的发放和管理，各地卫生健康委员会可以根据实际情况，设立专门的中医健康管理师考试办公室，负责组织中医健康管理师考试和证书发放工作。

3、中医药行业组织

中医药行业组织是指在中国境内从事中医药事业的企事业单位、社会团体和个人组成的非营利性社会组织，这些组织可以接受国家卫生健康委员会和各级卫生健康委员会的领导，协助开展中医健康管理师培训、考试和证书发放工作，目前，国内较为知名的中医药行业组织有中国中医药学会、中华中医药学会等。

4、职业培训机构

职业培训机构是为满足社会各类人才培训需求而设立的教育服务机构，在中医健康管理师培训领域，国内外有很多知名的职业培训机构，如北京中医药大学、上海中医药大学等，这些培训机构可以为有意向成为中医健康管理师的人员提供专业的培训课程和实践机会，帮助他们掌握中医健康管理的基本理论和技能，从而顺利通过考试并获得证书。

5、其他相关部门

除了上述几个主要的中医健康管理师证发证机构外，还有一些其他相关部门也可能参与到中医健康管理师证书的发放工作中，教育部门可以负责组织相关教材和考试大纲的编写；人力资源部门可以负责招聘和选拔合格的中医健康管理师；社会保障部门可以负责为取得中医健康管理师证书的人员提供相应的社会保障待遇等。

中医健康管理师证发证机构涉及多个政府部门和事业单位，共同构成了一个完整的管理体系，这个体系既保证了中医健康管理师证书的权威性和公信力，也为广大有意从事中医健康管理工作的人员提供了一个清晰的职业发展路径，在未来，随着中医健康产业的不断发展和壮大，中医健康管理师证发证机构将进一步完善和发展，为推动中医药事业的繁荣做出更大的贡献。