心理咨询师证书发放机构是指负责管理和监督心理咨询行业发展的政府部门或专门的机构，在中国，心理咨询师证书发放主要由以下几个部门负责：
1、人力资源和社会保障部(简称人社部):人社部是中华人民共和国国务院组成部门之一，主要负责制定和实施国家职业资格证书制度，根据《中华人民共和国职业技能法》和相关规定，人社部负责心理咨询师职业资格证书的颁发和管理。
2、国家卫生健康委员会(简称卫健委):卫健委是中华人民共和国国家卫生健康委员会的简称，主要负责制定和实施国家卫生健康政策、法规和标准，根据《中华人民共和国心理健康法》和相关规定，卫健委负责对心理咨询师的专业能力进行评估和监管。
3、中国心理学会(简称中国心理学会):中国心理学会是一个全国性的专业性学术组织，旨在促进心理学的发展和应用，中国心理学会负责组织和实施心理咨询师的职业能力培训和考试，以及对心理咨询师的专业能力进行评价和认证。
4、其他地方政府相关部门：在各省、自治区、直辖市，也有相应的人力资源和社会保障厅、卫生健康委员会等政府部门负责心理咨询师证书的发放和管理，这些部门会与国家层面的相关部门密切合作，确保心理咨询师证书的权威性和有效性。
心理咨询师证书发放机构的主要职责包括：
1、制定心理咨询师职业资格证书的考试大纲、考试内容和评分标准。
2、组织实施心理咨询师职业能力培训和考试，确保培训质量和考试公平公正。
3、对参加考试并合格的人员颁发心理咨询师职业资格证书。
4、对已取得心理咨询师职业资格证书的人员进行注册管理，确保其专业能力和服务质量。
5、定期对心理咨询师行业进行监管和评估，发布行业发展报告和指导意见。
6、加强与国际心理学组织的交流与合作，推动心理咨询行业的国际化进程。
心理咨询师证书发放机构是由多个政府部门和专业性学术组织共同参与的管理体系，旨在确保心理咨询师的专业素质和服务质量，为广大民众提供专业、高效、便捷的心理健康服务。