心理咨询师证书的颁发主要由国家卫生健康委员会(原卫生部)负责，在2017年，国家卫生健康委员会进行了机构改革，将原卫生部的职责整合到了新组建的国家卫生健康委员会，心理咨询师证书的颁发现在归属于国家卫生健康委员会下属的职业健康司。
要获得心理咨询师证书，首先需要参加由国家卫生健康委员会认可的心理咨询师培训课程，这些课程通常包括心理学理论、心理咨询技巧、心理评估方法等方面的内容，完成培训后，学员需要通过笔试和实践操作考核，以证明自己具备从事心理咨询工作的能力。
在考试合格后，学员可以向当地卫生健康行政部门申请颁发心理咨询师资格证书，具体的申请流程可能因地区而异，一般包括提交相关材料、填写申请表、参加面试等环节，在申请过程中，申请人需要提供身份证明、学历证明、培训证明等文件，部分地区还要求申请人进行职业道德承诺，保证在执业过程中遵守相关法律法规和职业道德规范。
获得心理咨询师资格证书后，申请人还需要在具有资质的医疗机构或社会组织进行实习或实践，实习期间，申请人将在指导老师的指导下开展心理咨询工作，积累实践经验，实习期满后，申请人需通过考核，才能获得心理咨询师执业证书，执业证书是对申请人具备独立从事心理咨询工作能力的一种证明。
值得注意的是，心理咨询师证书的有效期通常为5年，过期后，申请人需要重新参加培训并通过考核，才能继续从事心理咨询工作，随着心理学研究的发展和社会需求的变化，心理咨询行业对专业素质的要求也在不断提高，心理咨询师需要不断学习和更新知识，提高自己的专业能力。
心理咨询师证书的颁发主要由国家卫生健康委员会负责，涉及多个部门的协作，要获得心理咨询师证书，学员需要参加培训、通过考试、实习实践等一系列环节，在获得证书后，心理咨询师还需要不断提升自己的专业能力，以满足社会的需求。