国家三级心理咨询师证书补办流程是指在原国家三级心理咨询师证书遗失、损坏或者过期的情况下，申请人按照相关法律法规和政策要求，通过一定的程序重新办理新的证书，具体流程如下：

1、申请人提交书面申请：申请人需要向原颁发单位(通常是各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅)提交书面申请，说明原证书的丢失、损坏或过期情况，并提供相关证明材料。

2、核实申请人信息：原颁发单位在接到申请后，会对申请人的身份信息进行核实，确保申请人是原证书的合法持有人，这一步骤可能需要申请人提供身份证明、学历证明等材料。

3、申请人接受心理评估：根据《心理咨询师职业资格标准》和相关规定，申请人需要接受一次心理评估，评估结果将作为补办证书的重要依据，评估可以由原颁发单位组织，也可以由其他具有资质的心理评估机构进行。

4、缴纳相关费用：申请人需要按照规定的标准缴纳相关费用，包括补办证书的费用和心理评估的费用，费用的具体数额因地区而异，一般由原颁发单位规定。

5、领取新证书：在完成上述步骤后，原颁发单位会在一定时间内对申请人的申请进行审核，审核通过后，申请人可以按照约定的时间和地点领取新的国家三级心理咨询师证书，新证书上会注明原证书的作废信息，以示区别。

6、更新个人档案：申请人在领取新证书后，需要将新证书的信息录入个人档案，并在相关单位和网站上进行更新，这有助于提高心理咨询师的专业形象，同时也有利于行业监管部门对心理咨询行业的管理和监督。

需要注意的是，不同地区的补办流程可能会有所差异，具体操作时请以当地人社部门的要求为准，补办国家三级心理咨询师证书并不意味着恢复原来的职业资格，只是重新获得了一个新的证书，对于已经失去原证书的心理咨询师来说，补办新证书仍然是继续从事心理咨询工作的必要条件。