心理咨询师证书的颁发机构有很多，包括国内外知名的大学、专业培训机构、行业协会等，不同的机构颁发的证书在含金量、认可度和考试难度等方面都有所不同，选择一个好的心理咨询师证书颁发机构非常重要。
在国内，比较知名的心理咨询师证书颁发机构有北京师范大学心理学院、华东师范大学心理与认知科学学院、南京师范大学心理学院等高校，这些高校的心理咨询师证书具有很高的权威性和认可度，是从事心理咨询工作的必备证书之一，还有一些专业的培训机构也会颁发心理咨询师证书，如新东方、博雅等，这些机构的证书在市场上也有一定的认可度，但相较于高校的证书，其权威性和认可度可能会稍低一些。
在国外，美国的美国心理学会(APA)和加拿大的加拿大心理学会(CPA)都是非常知名的心理咨询师证书颁发机构，这两个机构的证书在全球范围内都有很高的认可度和权威性，还有一些国际性的心理咨询师证书，如国际临床心理学家协会(ICF)颁发的临床心理咨询师认证(CPC),以及欧洲临床心理学家协会(EFP)颁发的欧洲临床心理治疗师认证(EPC)等，这些国际性的证书在国际上具有很高的权威性和认可度，对于想要在国际领域发展的人来说是非常有价值的。
选择一个好的心理咨询师证书颁发机构非常重要，在选择时，可以从以下几个方面进行考虑：了解不同机构的背景和历史，以及它们在心理咨询领域的声誉和影响力；了解证书的课程设置、考试难度和通过率等；可以参考其他从业者的经验和评价，了解他们对不同机构颁发的证书的看法，通过综合考虑这些因素，可以选择一个最适合自己的心理咨询师证书颁发机构。