心理咨询师证书发放机构的审核部门通常包括以下几个方面：
1、国家卫生健康委员会(National Health Commission of the People's Republic of China,简称NHC):作为中国政府部门，NHC负责制定和发布心理咨询行业的政策法规，对心理咨询师的职业资格进行统一管理和监督，在心理咨询师证书发放过程中，NHC会对申请者的资质、培训经历、考试成绩等进行审核，确保其具备从事心理咨询工作的能力和素质。
2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会(卫健委):各级卫健委在国家卫生健康委员会的指导下，负责本地区心理咨询师职业资格的审核工作，申请者需要向所在省、自治区、直辖市的卫健委提交相关材料，由其进行初步审核，通过初审后，申请者需参加全国统一的心理咨询师考试，取得合格成绩后方可获得证书。
3、人力资源和社会保障部(MOHRSS):人社部负责管理全国范围内的职业技能鉴定工作，对心理咨询师证书的发放进行监督，在证书发放过程中，人社部会对申请者的考试成绩、培训记录等进行审核，确保证书的真实性和有效性。
4、国际心理协会(International Association for Psychological Studies,简称IASP):作为一个国际性的心理学组织，IASP与中国的心理咨询行业有着密切的合作关系，IASP会对符合其标准的心理咨询师证书进行认证，以确保证书的质量和权威性，在中国从事心理咨询工作的心理咨询师，需要获得IASP认证的证书方可在全球范围内通行无阻。
5、中国心理学会(Chinese Psychological Association,简称CPA):中国心理学会是中国心理咨询行业的权威组织，负责对心理咨询师的专业水平进行评价和认证，在中国从事心理咨询工作的心理咨询师，需要通过中国心理学会的认证，才能获得心理咨询师证书。
6、各地心理咨询师培训机构：为了帮助人们更好地学习和掌握心理咨询技能，各地设有专门的心理咨询师培训机构，这些机构会对参加培训的人员进行严格的考核和筛选，确保培训质量，在完成培训并通过考试后，学员可以获得由培训机构颁发的结业证书，但这并不是真正的心理咨询师证书，只是证明学员具备了一定的理论知识和实践能力。
心理咨询师证书发放机构的审核部门主要包括国家卫生健康委员会、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会、人力资源和社会保障部、国际心理协会、中国心理学会以及各地心理咨询师培训机构，这些部门共同参与到心理咨询师证书的审核工作中，确保证书的真实性、权威性和有效性。