电子商务师证考试分为理论知识考试和操作技能考核两部分，采用百分制，两项成绩皆达到60分以上者为合格。
理论考试部分以闭卷笔试或机考的方式进行，题型分标准化和非标准化两种，当前的发展推广方向是前者，它一般有两种组成方式：其一是全选择题形式，共100道单选题，每题为1分，考试时间为90分钟或120分钟；另一种是80道单选题和20道判断题的组合，每题为1分，考试时间为90分钟或120分钟。
操作技能考核部分包括实验操作、方案设计、综合操作等。
