全国外贸单证员证书颁发机构是中华人民共和国商务部，商务部作为国务院组成部门，负责制定和实施对外贸易政策、法规和战略，推动对外经济合作与发展，商务部下设多个部门，其中包括外贸司，主要负责我国对外贸易的管理和监督工作。
外贸司的主要职责包括：研究制定对外贸易政策、法规和发展战略；组织实施对外贸易促进计划；负责对外贸易经营者登记管理；指导和协调对外贸易业务和国际经济技术合作业务；监督管理外商投资企业经营活动；负责对外贸易壁垒调查和应对措施的研究、制定和实施等。
在全国外贸单证员证书颁发方面，商务部设有专门的培训和考核机构，负责对全国范围内的外贸单证员进行培训、考核和发证工作，这些培训和考核机构遍布全国各地，包括商务部直属单位、各省、自治区、直辖市商务主管部门以及各地外贸行业协会等。
外贸单证员是指在外贸企业、进出口商品交易会等场所从事外贸业务的人员，主要负责处理与国际贸易有关的单证工作，如报关单、装箱单、发票、提单等，外贸单证员的技能和素质直接关系到我国外贸业务的顺利进行，对外贸单证员的培训和考核具有重要意义。
为了提高外贸单证员的专业素质和业务能力，商务部制定了一系列的培训大纲和教材，包括外贸业务知识、国际贸易规则、单证操作技能等方面，商务部还定期组织各类培训班和考试，以确保外贸单证员能够掌握最新的业务知识和技能。
在证书颁发方面，商务部会对参加培训并通过考核的外贸单证员进行资格认定，并发放全国外贸单证员证书，持有全国外贸单证员证书的人员，可以在外贸企业、进出口商品交易会等场所从事与国际贸易有关的单证工作，享受一定的职业发展机会和待遇。
全国外贸单证员证书颁发机构是中华人民共和国商务部，其主要职责是负责对全国范围内的外贸单证员进行培训、考核和发证工作，商务部通过制定培训大纲、教材和组织各类培训班和考试，不断提高外贸单证员的专业素质和业务能力，为我国外贸事业的发展做出了积极贡献。