小儿推拿师资格证发证机关是指负责颁发小儿推拿师资格证书的政府部门或机构，在中国，小儿推拿作为一种传统的中医治疗方法，已经得到了广泛的认可和应用，为了规范小儿推拿行业，保障患者的权益，中国政府对小儿推拿师的资质进行了明确的规定。
根据《中华人民共和国中医药法》和《中华人民共和国职业技能鉴定条例》，小儿推拿师资格证的发放主要由以下几个部门或机构负责：
1、国家卫生健康委员会：作为中医药行业的主管部门，国家卫生健康委员会负责制定小儿推拿行业的政策法规，对小儿推拿师的培训、考核和资质认证进行指导和监督。
2、人力资源和社会保障部：人力资源和社会保障部负责职业资格考试的组织和管理，包括小儿推拿师资格证的考试和发放，考试内容包括理论知识和实际操作技能，以确保小儿推拿师具备扎实的专业知识和良好的实践能力。
3、地方卫生健康委员会：各级地方卫生健康委员会在国家卫生健康委员会的指导下，负责本地区的小儿推拿师培训、考核和资质认证工作，地方卫生健康委员会可以根据本地实际情况，制定具体的培训计划和考核标准。
4、行业协会和培训机构：行业协会和培训机构负责组织小儿推拿师的培训工作，提供专业的教学资源和服务，通过培训和考核，学员可以获得小儿推拿师资格证书，成为合格的小儿推拿师。
5、企事业单位：在企事业单位中从事小儿推拿工作的人员，需要参加小儿推拿师培训并取得资格证书，企事业单位应当加强对员工的培训和管理，确保员工具备足够的专业素质和技能水平。
小儿推拿师资格证发证机关是由国家卫生健康委员会、人力资源和社会保障部、地方卫生健康委员会、行业协会和培训机构以及企事业单位等多个部门和机构共同参与的，通过这些部门和机构的协同合作，确保小儿推拿行业的健康发展，为广大患者提供优质的服务。