在填写中医理疗师证发证单位时，需要根据自己的实际情况选择合适的单位，可以选择以下几种类型的单位：
1、中医药院校：如果你是在中医药院校学习中医理疗相关专业的，那么可以选择学校的名称作为发证单位，这样可以证明你所学的专业是经过正规学校认证的，具有一定的权威性。
2、中医药机构：如果你是在中医药机构从事中医理疗工作的，那么可以选择该机构作为发证单位，这样可以证明你所从事的工作是在正规机构进行的，具有一定的实践经验。
3、中医药行业协会：如果你是在中医药行业协会从事中医理疗相关工作的，那么可以选择该协会作为发证单位，这样可以证明你所从事的工作是在行业内得到认可的，具有一定的专业性。
4、其他相关机构：如果你是在其他相关机构从事中医理疗工作的，比如民间医疗机构、保健中心等，那么也可以选择这些机构作为发证单位，这样可以证明你所从事的工作是在社会上得到认可的，具有一定的实用性。
无论选择哪种类型的单位作为发证单位，都需要确保该单位具有合法资质和良好声誉，在填写证书上也需要注明具体的证书编号和日期等信息，以便于后续的使用和管理。