健康管理师证是由国家卫生健康委员会(原卫生部)颁发的，主要负责对健康管理师进行职业资格认证和管理，各级卫生健康行政部门、人力资源和社会保障部门、中医药管理部门等都有权对健康管理师进行管理和监督。
各级卫生健康行政部门是健康管理师证的主要管理部门，他们负责制定健康管理师的培训计划、考试大纲和考试题库，组织健康管理师的培训和考试工作，在健康管理师取得资格证书后，卫生健康行政部门还会对其进行职业资格认定，颁发职业资格证书，卫生健康行政部门还会定期对健康管理师进行职业技能考核，以确保其专业技能水平得到提升。
人力资源和社会保障部门也是健康管理师证的重要管理部门之一，他们负责将健康管理师纳入国家职业资格目录，为健康管理师提供就业、晋升等方面的政策支持，人力资源和社会保障部门还会对健康管理师的工资待遇、职称评定等方面进行指导和监督。
中医药管理部门也对健康管理师证的管理负有责任，随着中医药在现代医疗体系中的地位日益提高，越来越多的健康管理师开始涉足中医药领域，为此，中医药管理部门制定了相关政策和标准，对从事中医药健康管理工作的健康管理师进行职业资格认证和管理。
在实际工作中，各级卫生健康行政部门、人力资源和社会保障部门、中医药管理部门等会密切配合，共同推进健康管理师证的管理工作，卫生健康行政部门会协助人力资源和社会保障部门对健康管理师进行职业资格认定；人力资源和社会保障部门则会协助卫生健康行政部门制定培训计划和考试大纲等，通过各部门的共同努力，健康管理师证的管理得到了有效保障，为我国健康产业的发展提供了有力支持。
健康管理师证的管理涉及多个部门，包括国家卫生健康委员会、各级卫生健康行政部门、人力资源和社会保障部门、中医药管理部门等，这些部门各司其职，共同推进健康管理师证的管理工作，为我国健康产业的发展提供了有力保障，在未来，随着我国健康产业的不断发展壮大，健康管理师证的管理也将不断完善和发展。