运动康复师证发证机关是指负责颁发运动康复师资格证书的政府部门或机构，在中国，运动康复师证发证机关通常为国家卫生健康委员会(原卫生部)或其下属的职业技能鉴定指导中心。
填写运动康复师证发证机关时，需要根据实际情况选择相应的部门或机构名称，以下是一些建议：
1、如果您的学校或培训机构与国家卫生健康委员会有合作关系，可以直接填写该部门名称。
2、如果您的学校或培训机构没有与国家卫生健康委员会合作，但您已经参加过由该部门或其他相关部门组织的培训课程并获得了证书，可以填写国家卫生健康委员会或其他相关部门的名称。
3、如果您不确定哪个部门或机构负责颁发运动康复师证书，可以咨询当地的卫生健康部门或职业技能鉴定指导中心。
4、在填写运动康复师证发证机关时，务必确保所填写的名称准确无误，以免影响后续的工作和证书的有效性。
在填写运动康复师证发证机关时，要根据自己的实际情况选择正确的部门或机构名称，并确保信息的准确性，希望这些建议对您有所帮助。