中医针灸师证的发证机关是指负责管理和监督中医针灸师培训、考试和发证工作的政府部门或机构，在中国，中医针灸师证的发证机关主要由国家卫生健康委员会(原卫生部)和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会共同承担。
自2017年起，国家卫生健康委员会负责全国范围内的中医针灸师培训、考试和发证工作，各级卫生健康委员会在国家卫生健康委员会的指导下，负责本辖区内的中医针灸师培训、考试和发证工作，为了确保中医针灸师的专业素质和技能水平，国家卫生健康委员会制定了一系列关于中医针灸师培训、考试和发证的政策法规和标准。
中医针灸师培训分为初级、中级和高级三个层次，初级培训主要针对中医药专业的在校生和从事中医针灸工作的人员，通过理论学习和实践操作相结合的方式，培养其基本的中医针灸知识和技能，中级培训主要针对已经取得初级证书的人员，通过深入学习和实践操作，提高其中医针灸专业技能，高级培训主要针对具有一定临床经验和专业水平的中医针灸师，培养其在临床实践中解决疑难问题的能力。
中医针灸师考试分为理论考试和实践操作考试两部分，理论考试主要测试考生对中医基础理论、中药学、针灸学等方面的知识掌握程度；实践操作考试主要测试考生运用中医针灸技术进行诊断和治疗的能力，考试成绩按照一定的权重计算，达到规定的分数线的考生方可获得相应的中医针灸师证书。
中医针灸师证书分为初级、中级和高级三个等级，初级证书适用于从事初级中医针灸工作的人员；中级证书适用于具有一定临床经验和专业水平的中医针灸师；高级证书适用于在中医药领域具有较高学术地位和影响力的专家学者。
中医针灸师证的发证机关是负责管理和监督中医针灸师培训、考试和发证工作的政府部门或机构，在中国，这一职责主要由国家卫生健康委员会和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会共同承担，通过严格的培训、考试和发证制度，确保了中医针灸师的专业素质和技能水平，为维护人民群众的健康作出了积极贡献。