中医针灸理疗师证书的考试机构有很多，例如国家中医药管理局中医师资格认证中心，您还可以参加一些培训机构的课程，这些机构会提供中医针灸理疗师证书的培训和考试服务，中国中医科学院针灸研究所、北京中医药大学东方医院等。