心理咨询师证书发放机构主要负责对经过专业培训并通过考试的心理咨询师进行认证和资质颁发，在中国，有多个单位和机构承担着这一重要职责，主要包括以下几类：

1、国家人力资源和社会保障部(简称人社部):人社部是中国大陆地区心理咨询师证书发放的主要部门，负责制定心理咨询师职业资格标准和考试大纲，组织实施全国统一的心理咨询师职业资格考试，考试合格者可由人社部颁发心理咨询师职业资格证书。

2、各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅(局):各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅(局)在人社部的指导下，负责本地区的心理咨询师职业资格考试组织和证书发放工作，考生在本省报名参加考试并合格后，可由所在省人力资源和社会保障厅(局)颁发心理咨询师职业资格证书。

3、各大高校心理咨询中心：许多中国的高校都设有心理咨询中心，为在校学生提供心理咨询服务，这些中心的一部分工作人员会接受专业的心理咨询培训，并在完成学业后报考心理咨询师职业资格考试，考试合格者，可在所在高校心理咨询中心获得心理咨询师证书。

4、社会心理咨询机构：随着社会对心理健康服务的需求不断增加，越来越多的社会心理咨询机构应运而生，这些机构通常会聘请具备一定专业知识和经验的心理咨询师为客户提供服务，部分社会心理咨询机构会支持员工参加心理咨询师职业资格考试，并为通过考试的员工颁发证书。

5、中国心理学会：中国心理学会是一个在全国范围内具有权威性和专业性的学术组织，负责组织和推广心理学领域的学术交流和研究工作，中国心理学会的部分会员单位会设立心理咨询师培训和考证项目，协助学员完成心理咨询师职业资格考试，考试合格者，可由中国心理学会颁发心理咨询师培训合格证书。

6、其他相关行业协会和组织：除了中国心理学会外，还有一些其他与心理咨询相关的行业协会和组织，如中国心理卫生协会、中国婚姻家庭咨询学会等，这些协会和组织也会开展心理咨询师培训和考证项目，协助学员完成心理咨询师职业资格考试。

心理咨询师证书发放机构主要包括国家人力资源和社会保障部、各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅(局)、各大高校心理咨询中心、社会心理咨询机构、中国心理学会以及其他相关行业协会和组织，这些机构共同推动着中国心理咨询行业的发展，为广大民众提供专业、优质的心理健康服务。