卫生部的中医针灸师证考试科目包括：中医基础理论、中医诊断学、中药学、针灸学、推拿学、康复医学等 ，还需要参加国家中医药管理局组织的全国中医药专业技术资格考试，取得相应职称后，方可申请颁发《中华人民共和国职业资格证书》。