心理咨询师证书发放机构的审核部门通常包括以下几个方面：
1、国家卫生健康委员会(National Health Commission of the People's Republic of China,简称NHC):作为中国政府部门，NHC负责对心理咨询师的职业资格进行统一管理和监督，NHC下设的职业技能鉴定中心负责组织和实施心理咨询师职业资格考试，考试合格者由NHC颁发心理咨询师证书。
2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会(以下简称省级卫生健康委员会):在国家卫生健康委员会的指导下，各级卫生健康委员会负责本辖区内心理咨询师职业资格的审核和管理，省级卫生健康委员会需将考试通过的申请人报送至国家卫生健康委员会备案。
3、行业协会或认证机构：为了规范心理咨询行业，一些行业协会或专业认证机构也会参与到心理咨询师证书的审核工作中，这些机构会对申请者的专业知识、实践经验等方面进行评估，确保其具备从事心理咨询工作的能力和素质。
4、用人单位或用人单位：在心理咨询师证书发放过程中，用人单位或用人单位也会对其招聘的心理咨询师进行审核，这些单位会要求心理咨询师提供相关证明材料，如学历证书、职业资格证书等，并对其专业能力、工作经验等方面进行评估。
5、个人申请：心理咨询师证书的申请人需要向相关部门提交书面申请，包括个人基本信息、学历背景、工作经验、专业培训经历等内容，这些信息将由上述多个部门进行审核，以确保申请人符合心理咨询师职业资格的要求。
6、审核结果公示：经过多部门的审核，符合条件的心理咨询师将获得证书，证书上会注明发证部门、证书编号等信息，部分地区还会对审核结果进行公示，以接受社会监督。
心理咨询师证书发放机构的审核部门涉及多个层级和部门，包括国家卫生健康委员会、省级卫生健康委员会、行业协会或认证机构、用人单位或用人单位等，这些部门共同参与到心理咨询师证书的审核工作中，确保心理咨询行业的健康发展。