中医针灸师证是由国家卫生健康委员会颁发的，是国家承认的职业资格证书，根据《中华人民共和国职业教育法》和《职业技能等级证书管理办法》，职业技能等级证书由国务院有关部门或者省、自治区、直辖市人民政府主管部门负责组织实施。

目前，国家卫生健康委员会下设的中医药管理局负责中医药行业的管理，包括中医药人员资格认证、职称评审等工作，中医针灸师证也是由中医药管理局颁发的。

各省、自治区、直辖市也设有中医药管理部门，负责本地区的中医药管理工作，如果您想要获得中医针灸师证，可以向当地的中医药管理部门咨询具体的申请流程和要求。

需要注意的是，不同地区颁发的中医针灸师证可能存在一定的差异，但都是合法有效的职业资格证书，在选择颁发机构时，可以根据自己的实际情况和需求进行选择。