中医针灸理疗师证书的考试费用和培训课程费用因地区和机构而异，中国医学科学院健康科普研究中心组织的中医针灸理疗师培训课程费用为3980元，包括所有的学习材料和考试费用，其他机构的培训费用可能会有所不同。