推拿师证书是国家职业资格证书，由国家人力资源和社会保障部颁发，根据《中华人民共和国职业教育法》和《职业技能鉴定条例》，职业技能鉴定分为职业技能等级认定和职业技能资格认证两个层次，职业技能资格认证包括职业资格证书和职业技能等级证书两种形式。

目前，国家承认的推拿师证书有三种：全国通用的高级技师、中级技师和初级技师；各省市自行颁发的高级、中级、初级推拿师证书；以及一些行业协会或机构颁发的专项技能证书，这些证书都是经过严格的考核和评定程序后颁发的，具有一定的权威性和可信度。

至于哪个部门好发推拿师证书，这要根据您所在的地区和具体需求来决定，您可以选择向当地劳动保障部门或职业技能鉴定中心咨询相关政策和流程，一些大型医疗保健机构、按摩院、养生馆等也会提供相关的培训和考核服务，您也可以了解一下他们的具体情况。