家庭教育咨询指导师证书颁发单位是指在家庭教育领域具有权威性和专业性，对家庭教育咨询指导师的培训、考核和认证进行统一管理和监督的组织，家庭教育咨询指导师证书颁发单位主要由以下几类：

1、教育部直属事业单位：中国教育科学研究院、全国教育发展研究中心等，这些单位在教育领域具有较高的声誉和权威性，对家庭教育咨询指导师的培训和认证具有一定的参考价值。

2、各省市教育局：各省市教育局下属的教育科学研究所、教育信息中心等部门，负责本地区家庭教育的研究工作，对家庭教育咨询指导师的培训和认证也有一定的影响。

3、专业培训机构：如新东方、好未来等知名教育机构，这些机构通过专业的课程设置和师资力量，对家庭教育咨询指导师进行系统的培训，并颁发相应的证书，虽然这些机构的证书在社会认可度上可能不如前两类单位的证书，但对于个人职业发展来说，也是一份有价值的资质证明。

4、国际组织和认证机构：如美国儿童发展协会(ATD)、国际家庭教育学会(IFE)等，这些国际组织和认证机构在全球范围内具有较高的知名度和权威性，其颁发的家庭教育咨询指导师证书在国际上具有一定的认可度。

5、其他相关行业协会和组织：如中国家庭教育研究会、中国婚姻家庭研究会等，这些组织开展了丰富多样的家庭教育研究和活动，对家庭教育咨询指导师的培训和认证也有一定的作用。

家庭教育咨询指导师证书颁发单位涉及多个领域和部门，具有不同的特点和优势，在选择证书颁发单位时，个人应根据自己的实际情况和发展需求，综合考虑各单位的特点、培训内容和教学质量等因素，做出合适的选择，获得家庭教育咨询指导师证书并不意味着具备了完全的专业能力，个人还需要不断学习和实践，提高自己的专业素养和服务水平。