家庭教育指导师发证机构主要是指负责家庭教育指导师培训、考核和发证的政府部门或专门机构，家庭教育指导师发证机构主要包括以下几个部门：

1、教育部：教育部负责全国范围内的教育工作，包括家庭教育的政策法规制定、教材编写和教师培训等方面，教育部会定期组织家庭教育专家和学者进行研讨，以便更好地指导家庭教育工作。

2、人力资源和社会保障部：人力资源和社会保障部负责全国范围内的职业培训和技能提升工作，包括家庭教育指导师的培训和考核，该部门会与各地教育部门合作，共同制定家庭教育指导师的培训课程和考核标准。

3、卫生健康委员会：卫生健康委员会负责全国范围内的健康教育和健康促进工作，包括家庭教育的健康指导，该部门会与教育部门合作，共同开展家庭教育健康知识的普及和宣传活动。

4、各省、自治区、直辖市教育厅(局):各省、自治区、直辖市教育厅(局)负责本辖区内的教育工作，包括家庭教育指导师的培训和考核，各地区的教育厅(局)会与当地人力资源和社会保障部门合作，共同制定家庭教育指导师的培训课程和考核标准。

5、社会培训机构：社会培训机构是家庭教育指导师发证机构的重要组成部分，它们负责为有意愿从事家庭教育指导工作的人员提供专业的培训课程和实践机会，这些培训机构需要符合国家相关政策要求，接受相关部门的监管和管理。

6、专业协会和学术组织：专业协会和学术组织是家庭教育指导师发证机构的重要补充力量，它们通过组织各类学术活动、研讨会和培训班等方式，推动家庭教育指导师的专业发展和交流合作，这些协会和组织需要遵守国家相关政策要求，接受政府部门的指导和管理。

家庭教育指导师发证机构涉及多个部门和领域，需要各方共同努力，才能更好地推动家庭教育事业的发展，在选择家庭教育指导师培训机构时，建议广大家长和学员关注发证机构的资质、师资力量、培训课程和服务质量等方面的信息，以确保自己能够获得专业、有效的家庭教育指导。