全媒体运营师证书的发放部门通常是由国家人力资源和社会保障部、中国传媒大学等相关部门负责，中国传媒大学是全国最早开设全媒体运营相关专业的高校之一，其颁发的全媒体运营师证书具有较高的权威性和认可度。

在选择全媒体运营师证书发放部门时，您可以考虑以下几个方面：

1、机构声誉和资质：选择具有较高声誉和资质的机构进行培训和考试，可以确保您所获得的证书具有较高的权威性和认可度，中国传媒大学的全媒体运营师培训课程由该校传媒与艺术学部教授授课，教学质量有保障。

2、师资力量：了解培训机构的师资力量，选择具有丰富行业经验和教学经验的老师进行授课，可以帮助您更好地掌握全媒体运营的相关知识和技能。

3、课程设置：了解培训机构的课程设置，选择涵盖全媒体运营各个方面的课程，可以帮助您全面系统地学习全媒体运营知识。

4、实践环节：关注培训机构是否提供实践环节，如实习、项目合作等，这些实践经验对于您将来在全媒体运营领域的发展非常重要。

5、就业指导：了解培训机构是否提供就业指导服务，如职业规划、简历指导、面试技巧等，这些服务可以帮助您在毕业后更好地找到合适的工作。

6、学费和时间：根据自己的经济条件和时间安排，选择合适的培训课程和周期，可以关注培训机构是否有优惠政策或者分期付款等方式，以减轻您的经济压力。

在选择全媒体运营师证书发放部门时，建议您综合考虑以上几个方面，选择具有较高声誉和资质的机构进行培训和考试，您还可以向已经在全媒体运营领域工作的同行请教，了解他们的培训经历和推荐的机构，以便为自己的选择提供更多的参考信息。