1.以局部取穴为主的三针体系，如“眼三针”“面肌针”等；2.以经络脏腑相关原理取穴的三针体系，如“胃三针”既有胃之募穴和局部取穴中脘穴，又有通阴维脉的内关穴，以及胃经合穴、胃下合穴足三里，既能调节脾胃脏腑功能，又能通调胃经、任脉、阴维脉等经络；3.结合现代医学生理病理基础补充的三针体系，如“颞三针”取穴对应颞叶的头皮表面投影区，在对侧肢体运动障碍时多用。神识方面的异常，病位在心、脑、肾，与督脉、膀胱经循行关系最密切。该类穴位处方不仅有督脉、膀胱经局部取穴的“智三针”“四神针”“颞三针”“脑三针”（合称头四项），还包括以心经取穴为主的“手智针”，以肾经取穴为主的“足智针”。将大脑皮层的功能定位投影到头皮，我们发现“颞三针”对应颞叶、中央前回、中央后回的投影区，故对精神发育迟滞儿童的智力改善有作用，同时也可以治疗对侧肢体瘫痪或感觉异常；“四神针”对应了顶叶的区域，可改善记忆力，广泛用于脑病的治疗；“智三针”对应额叶，是提高智力的重要组穴；“脑三针”则对应小脑的头皮投影区，对平衡功能障碍有较好的改善作用。此类穴组多在病灶局部，如“眼三针”均在眼周；“耳三针”包括耳廓前的听宫、听会和耳廓后的完骨；“鼻三针”则包括鼻梁上方的印堂和鼻翼附近的鼻通、迎香。该类穴组疗效明确，可疏通局部经络，较远端取穴有更快、更明确的功效。如“面瘫针”以面部足阳明胃经腧穴为主，是面瘫的常用主要穴组，根据面瘫时期和证型再适当选择远端配穴。又如治疗三叉神经痛常用的主穴“叉三针”，就包含对应三叉神经第一支的阳白、鱼腰穴，对应第二支的四白穴，以及对应第三支的大迎穴。“靳三针”注重特定穴的应用，四肢部位穴组多包含五输穴、原穴、郄穴，而躯干部位组穴常包括背俞穴，此外交会穴也多有应用。如临床常用于治疗上肢功能活动障碍的“手三针”就包括手阳明大肠经的合穴曲池、原穴合谷，手少阳三焦经的络穴外关；而常用于治疗颈椎病的“背三针”则包括骨会大杼、背俞穴风门、肺俞；常用于治疗腰痛或活动障碍的“腰三针”也是由局部的背俞穴肾俞、大肠俞，和远端的足太阳膀胱经合穴委中组成。对于关节病变，除了上述取穴规律，“靳三针”的组穴还体现了围刺法的应用。如膝关节病变多用“膝三针”：血海、梁丘、内外膝眼，血海和梁丘均为郄穴，配合内外膝眼起到围针效果，加强行气活血通络之功效；踝关节病变常用“踝三针”：解溪、太溪、昆仑。合募配穴是“靳三针”中治疗脏腑病组穴的常见组合，其理论基础是募穴为脏腑之气输注于胸腹部的地方，而“合治内府”也提示下合穴可治脏腑病。比如常用于治疗肠炎、痢疾、便秘等肠道疾病的“肠三针”，取大肠募穴天枢、小肠募穴关元，配合大肠下合穴上巨虚，对肠腑气机有良好的调节作用。交会穴在“靳三针”中的应用，为涉及多经多腑的疾病治疗提供了思路。比如常用于治疗泌尿系统疾病或术后排尿障碍的“尿三针”，取小肠募穴关元、膀胱募穴中极，配合肝、脾、肾经的交会穴——三阴交，共同调节下焦的水液代谢。对于急性的神志异常，无论是脱证还是闭证，都源于阴阳之气不相顺接。取穴多在督脉和任脉的交接处，如人中见于“闭三针”“脱三针”“老呆针”；或阴阳经交接之处，如“闭三针”用十宣。而百会一穴为醒神开窍要穴，针之可疏通督脉经气，灸之可升提阳气，是“脱三针”重要的穴位。临床运用“靳三针”并不会拘泥于现有的穴位处方，关键在于辨证。通常会根据患者的具体情况对穴位处方进行加减或合用。此外，“靳三针”疗法要求施术者专意一神，其对治神和手法也有严格的要求。
